Настройки 1с документооборот можно разделить на несколько составляющих.
Настройки 1с документооборот связанные с очередью
Посмотреть ошибки при выполнении процессов в 1с Документооборот можно в справочнике «Очередь заданий документооборота».
Алгоритм решения у меня прошел следующий. Отключил выполнение заданий на клиенте (это обработка «Выполнение заданий (клиент)». После чего удалил уже «стартовавшие» задания в документах, и запустил процесс согласования заново. После чего включил выполнение заданий на клиенте (с одновременным добавлением процессов (было 5 сделал 50 и уменьшил время с 15 до 5 сек))